萎縮性鼻炎分為原發(fā)性和繼發(fā)性兩種。前者病因目前仍不十分清楚，后者病因則明確。

1、原發(fā)性萎縮性鼻炎：

原發(fā)性者的病因目前尚未清楚。

傳統(tǒng)的觀點認為本病是某些全身性慢性疾病的鼻部表現(xiàn)，如內(nèi)分泌紊亂、自主神經(jīng)功能失調(diào)、維生素缺乏（如A、B、D、E）、遺傳因素、血中膽固醇含量偏低等。

細菌，如臭鼻桿菌、類白喉桿菌等雖不是致病菌，但確是引起繼發(fā)感染的病原菌。

近年研究發(fā)現(xiàn)本病與微量元素缺乏或不平衡有關(guān)，免疫學(xué)研究則發(fā)現(xiàn)本病患者大多有免疫功能紊亂，組織化學(xué)研究發(fā)現(xiàn)鼻粘膜乳酸脫氫酶含量降低，故有學(xué)者提出本病可能是一種自身免疫性疾病。

總之，原發(fā)性者的病因目前尚未清楚。

2、繼發(fā)性萎縮性鼻炎：

目前已明確本病可繼發(fā)于以下疾病和情況——

（1） 慢性鼻炎、慢性鼻竇炎的膿性分泌物長期刺激鼻粘膜；

（2） 高濃度有害粉塵、氣體的持續(xù)刺激鼻粘膜；

（3） 多次或不適當鼻腔手術(shù)致鼻粘膜廣泛損傷（如下鼻甲過度切除）；

（4） 鼻特殊傳染病，如結(jié)核、梅毒和麻風等疾病損害鼻粘膜。